Prodi yang kedua adalah Prodi Ilmu Al-Qur’an dan Tafsir, yang diarahkan pada pendalaman terhadap pemikiran tafsir filosofis dan tafsir sufistik yang menjadi panduan dasar dalam mengawal pengembangan pemikiran dan filafat Islam dalam membangun Peradaban.
Menghasilkan para sarjana yang memiliki keahlian dalam bidang Ilmu Al-Quran dan Tafsir, mampu melakukan penelitian fenomena sosial dan keagamaan dan mencari alternatif pemecahanan masalahnya berbasiskan pada Ilmu Al- Quran dan Tafsir.
Menjadi pusat pendidikan, penelitian, dan pengembangan Ilmu Al Qur’an dan Tafsir di Indonesia, dalam upaya membangun kembali pemikiran Islam yang logis dan rasional dengan mengintergrasikan pesan-pesan dan nilai-nilai teks suci al Quran dan al Sunah Nabi dengan memaksimalkan peran akal dan hati dalam pemahaman dan pengamalan agama yang dapat berkontribusi pada kemajuan masyarkat dan membangun paradigma peradaban Islam di tingkat Nasional dan Internasioanl.
Akhlak, Akidah, Bahasa Arab, Bahasa Indonesia, Bahasa Inggris, Ilmu Budaya, Fiqh Praktis, Pengantar Logika, Metodologi Studi Islam, Falsafah Pancasila/Civic Education, Pengantar Filsafat, Sejarah Peradaban Islam, Pengantar Ulumul Hadits, Pengantar Ulumul Qur’an, IT Literasi,
Filsafat Ilmu, IImu kalam (Perbandingan Mazhab kalam), Ushul Fiqh, Filsafat Islam 1 (al-Masy a’iyah), Filsafat Islam 2 (al-Isyraqiyah), Filsafat Islam 3 (al-Hikmah al-Muta’aliyah), Pengantar Tasawuf, Filologi, Hermeneutika & Semiotika, Tasawuf Falsafi, Kalam Jadid (Teologi Kontemporer), Studi Tema-tema Filsafat Dalam Al-Qur’an dan Hadits, Metodologi Penelitian 1,
Metodologi Penelitian -2 (Tafsir), Ilmu Balaghoh-1, Ilmu Balaghoh-2, Ulumul Quran-1, Ulumul Quran-2, Ulumul Hadits, Tahfidz-1 (Juz 30), Tahfidz-2 (Juz 29), Tahfidz Maudu’i, Tafsir Tematis-1, Tafsir Tematis-2, Logika (Critical Thinking), Sirah Nabawiyah, Perkembangan Tafsir di Nusantara,  Madzahib Al-Tafsir,  Studi Mufrodat Al-Qur’an,  Qawaid Tafsir,  Ma’arif Qur’ani, Isu-isu Tafsir Kontroversial, Studi Naskah Tafsir-1,  Studi Naskah Tafsir-2 (Falsafi), Studi Naskah Tafsir 3 (Sufi), Tafsir Ahkam,  Tafsir Kontemporer, Studi Kitab Tafsir & Mufasir, Ad-dakhil Fi Tafsir, Al-Qur’an-Hadits dan Orientalisme, Kuliah Kerja Nyata (KKN), Praktik Profesi, Komprehensif & Skripsi.
Sosiologi Agama, Psikologi Agama, Metode Pembelajaran dan Menghafal Al-Qur’an, Retorika, Metode Penerjemahan Al-Qur’an, Seni Tilawah, Bahasa Farsi.
“INFORMASI BEASISWA DAN SELEKSI PENERIMAAN MAHASISWA BARU PROGRAM SARJANA (S1) STFI SADRA”